根据2008年中国科学技术信息研究所公布的《中国期刊引证报告（扩展版）》，《华中科技大学学报（自然科学版）》2007年总被引频次为2181，影响因子为0.517，均较上年有所提高。

另据2008年9月中国学术期刊（光盘版）电子杂志社发布的“中国知网”发行与传播统计报告，《华中科技大学学报（自然科学版）》2007年的机构用户总计2642个，分布在美国、法国、加拿大等9个国家和地区，用户行业包括高校、公共图书馆、政府、企业、医院、科研院所、军队等；个人读者分布在37个国家和地区；WEB下载页码为11085。